《再见女儿》阿生（李天柱饰）是台商，长居北京。他有两个妻子，一个是离婚多年的台湾前任（谢琼暖饰），一个是关系很好的北京现任（王冠饰）。阿生还有两个女儿，一个叫嘉欣（林子君饰），一个名叫莲莲（陈奕钦饰）。因为妹妹疼爱姐姐，她从北京来到台湾读大学。两人住在同一个屋檐下。妹妹刘莲在游泳队跳水活动中意外身亡。警方判定她因服用过量安眠药窒息而亡。他们认为与她同住的姐姐佳欣是一名资深潜水员，并与她一起下水。她涉嫌故意杀人罪。父亲阿升回到台湾照顾小女儿的后事，与疏远台湾已久的大女儿嘉欣重逢。北京的莲莲妈妈来到台湾，发誓要查明真相。阿生的前妻，嘉欣的妈妈发誓要保护嘉欣。而游泳队长薄言（黄尚河饰）的内心似乎隐藏着什么秘密……一对父女，两岸一家人，掀起一场关于往事的风波。