《卧底2》大子（赵大饰）作为我方派来华子（罗大华）的外籍技师，一年前被赵天一（赵一饰）派去金三角为华子做卧底。华子识破并杀死了在达孜危机中杀死新药配方的制药商，从而成为整个金三角唯一掌握新药配方的人。基于此，华子不仅没有杀掉大子，还以高价跟随大子。达成协议，同时大紫杀死了随卧底进来的战友，成为第一个加入大紫的人。从此，大紫断绝了关系，下定决心要与花紫合作，慢慢与上级组织失去了联系。赵天翼带着矛盾来到金三角，是为了激活另一个本土贩毒集团在中国大陆的二号人物（张璐饰）。原来，中国大陆，大子和毛乐曾经是赵天翼手下最厉害的三个手下，但是他们在金三角的卧底过程中，毛乐身份暴露，被大子亲手杀死，而大子和大陆渗透了华子和另一支贩毒势力郝哥（王功义饰）。两大贩毒组织中，大陆为了博取信任，从华仔的枪口中救出了豪哥。豪哥不仅将妹妹艾米（苏萌萌饰）嫁给了大陆，还与家人进行了交易。由大陆管理的，还有一个叫阿金的缅甸人越狱了。阿金看上去是个老实木，实则是缅甸警方派来的卧底。阿晋和大陆关系不错，但不知道对方的卧底身份。