《生理大叔和他的女儿》故事讲述了一个绰号“生理大叔”的男人的故事？三桥由纪夫（原田康三饰）和女儿因热点事件吵架后又和好。三桥由纪夫是一位单身父亲，在一家卫生用品公司担任公关人员。他有一个高中生女儿和一个初中生儿子。六个月前，他因为一段呼吁大家了解女性生理的视频，被封为“生理大叔”。但某天他在一档直播资讯综艺节目中与解说员北条うらら（菊地凛子饰）发生争执，还不小心说了句“我连女儿的月经期都清楚”，结果引发一场大火，连女儿？三桥花（上坂树里饰）受不了学校里的流言蜚语，离家出走。毕竟，他是否应该向他的女儿解释他们身体思维的差异并恢复旧思维？