《两不疑第二季》大陈国的皇帝不经意间交换了身份，原本互相厌恶的人却因为交换而意识到了彼此的难处。在交流的过程中，逐渐开始相互理解和信任。边疆危急关头，萧瑾云（实质上是徐禹）亲自出征稳定边疆，终于凯旋而归。就在两位皇帝和王后克服重重困难，成功回体后，鞑靼王后突然进了宫。与此同时，朝廷和反对派中，三皇子夺权的欲望也很明显……