《父亲的身份》故事发生在1948年，调查局重要成员余北平（陈建斌饰）被上级调往青城调查那里的一起命案。然而，事实上，于北平的真实身份正在被上级调查和怀疑。我们时刻处于危险之中。在青城，于北平认识了一个叫林莎（齐溪饰）的女人。作为一名美军中尉，她的真实身份是于北平失散多年的女儿。于北平还有一个小女儿，名叫徐丹妮（朱彦曼子饰）。这时，她在青城读大学期间与已婚大学教授发生婚外情。父亲之间的关系也因为于北平的特殊身份而陷入僵局。俞北平一方面要圆满完成上级交给的任务，一方面要斡旋狡猾奸诈的敌人，另一方面也要接受迷惑和误会来自他的近亲。他陷入了一场激烈的战斗。