《反贪风暴3》内地高官涉嫌指派小三到香港洗黑钱。为此，ICAC（廉政公署）卢志廉（古天乐）和JFIU（联合金融情报组）刘宝强（张志林）联合展开调查。但此时，卢某被控巨额财富来历不明，被廉政公署L组（内部纪律调查组）程德铭（郑嘉颖饰）调查，最终被停职。为了证明自己的清白，卢志廉千方百计找到举报他的女孩伊娃（邓丽君饰），而创作都与正在调查的洗钱案息息相关。不久之后，中国反贪局观察办公室主任洪亮（丁海峰饰）也来到了香港。他的优势是洗钱案的幕后黑手张部长（冯磊饰）。两岸联动，多部门合作，与黑道势力拼命比拼……