《德凯奥特曼》在特里加奥特曼与黑暗巨人的战斗多年后，地球再次迎来了一个安静的时代。现在基本没有怪物的踪迹，怪物带来的灾难效果也逐渐淡出了人们的视线。人类已经建立了火星殖民地，并计划组建新的团队，开辟第二个火星殖民地。地球上的人类已经开始了探索宇宙的旅程，现在他们已经进入了新领域的时代。结果，在探索的过程中，宇宙的魔法生命体斯菲亚突然出现在了主角宫下明日香所在的队伍面前。斯菲亚入侵地球，切断了地球与宇宙的完整通讯，地球变成了一颗岛状星球。纳达原本在太空港运送货物，却被斯菲亚袭击。