《图书馆战争：记忆之书》经过严格的考验，笠原郁（荣仓奈奈饰）逐渐成长为优秀的图书组特遣队成员。小田原图书馆守卫战后，她似乎终于发现，念诵多年的王子，就是经常摆出一副臭脸笃的教官（冈田润一饰）。有一天，于的父母意外来访，她很着急，因为她从来没有告诉他们她真正的工作。因病耳聋而失聪的少女中泽（土屋大凤饰）暗恋多年如兄的小牧美久（田中圭饰）。可谁知小牧被亮华团队指控向残疾人传播有害身心健康的罪名被逮捕。另一方面，一位名叫朝比奈修二（中村青饰）的博物馆研究员走近柴崎麻子（栗山千明饰），他和蔼的笑容背后另有打算。手冢光（空太子饰）接连接到神秘电话，来电者掌握着书队未来的命运……本片改编自有川博的原著。