《热血高校2》GPS与芹泽兵团激战后，铃兰高中进入了短暂的和平时期。芹泽玉（山田孝之饰）放弃了王位，而泷也源氏（小栗旬饰）则继续报复可怕的林天惠（深水元树饰）。八个月的时间一眨眼就过去了，铃兰与宿敌奉贤学院的纷争再次浮出水面。两年前，川西莲（阿部信之介饰）率领的铃兰军与道雄干雄率领的星园学园交战。混战中，川西将牧尾刺死，随后被送往少年看守所。为了防止进一步的伤亡，铃兰和奉贤签订了停战协议。两年后，川熙出狱，被奉贤书院追杀。芹泽出面阻挠，泷也的介入甚至破坏了双方的停战协议。大河鸣人（金子菜菜子饰）和水户龙也（三浦春马饰）接受了牧尾的意志，决定以此为契机，彻底摧毁宿敌铃兰高中……