《老大2》第二季的故事将从上一季最后一集的剧情开始。警视厅第一科被强制解散，所长大泽绘里子（奄美由纪饰）辞职，正准备从成田机场启程返回美国，但在机场等候时，接到了登堀的电话真次郎（竹野内由纪饰）。.高级警官黑原贤三将成为反政府组织的下一个目标，而主要成员高仓龙平则在护送下逃脱。虽然惠理子和对策室的成员赶到了现场，但黑原还是中枪，凶手逃走了。重伤的黑原被迫辞职。为了承担责任，对策室再次解散，惠理子前往美国。两年后，成为顾问的叶璃接手了一个重要案件，以此为契机，让对策室复活。木本进（户田绘香饰）、片桐根豆子（玉山哲司饰）、镜田一平（水田纯平饰）、山村圭介（温水洋一饰）、岩井善治（小林雄二饰），这群乌合之众Will他们能够再次聚在一起，为惠理子和对策室工作吗？而叶璃这次是否还能说服绘里子担任办公室……