《橘色奇迹》菜穗（花泽香菜配音）在高二那年收到一封信，寄信人是来自10年后的自己。未来的她有许多后悔的事，因此为了不让现在的菜穗具有相同的悔恨，才寄来这封信。信上的实质是对于转学生翔（山下诚一郎配音）。从翔转来的第成天开始，直到翔离开尘世的这段期间，菜穗有许多机会改变未来。但是重点并非做出怎样的选择，而是要真正拯救翔的心，才有可能让未来的菜穗不再留有遗憾。当下的时光与10年后的未来该如何交错……