《黄石的孩子》英国记者乔治·霍克（乔纳森·莱斯·迈耶斯饰）潜入南京，意图将日本的暴行公之于众。然而，他被日军发现了。就在他即将被斩首之际，一名中国游击队员陈汉生（周润发饰）救出了何克，并遇到了外地医生李（拉达·米切尔饰）。何克搬到黄石，与60多个孤儿生活在一起。孩子们被打架折磨，对外国人有抵触情绪，甚至不尊重。然而，随着时间的推移，霍克的热情和爱心依然感动着孩子们，短短几个月时间，他们的生活和周边环境有了很大的改善。幸运的是，王太太（杨紫琼饰）得到了帮助。生活逐渐走上稳定的轨道，战斗的脚步也逐渐临近。何克和韩生有礼决定带孩子去山丹这个人迹罕至的地方。旅途艰辛，同伴的死亡也无法阻止他们。然而，一场疾病仍然影响着汉克、丽和孩子们的生活……