《反恐疑云》埃及裔美国人安瓦尔·易卜拉欣（奥马尔·梅特瓦利饰）大约二十年前从埃及移民到美国，与美丽的美国女孩伊莎贝拉·菲尔（IsabellaPhil）一起。泽（丽兹威瑟斯彭饰）有家庭，有爱的生活，有一个儿子，还有一个在伊莎贝拉肚子里的第二个孩子。一天，安瓦尔·易卜拉欣从南非出差回来，在华盛顿机场被一名神秘的黑衣人带走，因为中央情报局认为安瓦尔·易卜拉欣是一名化学工程师。卜拉希米是一名恐怖分子，试图从他嘴里窃取有用的信息。倒霉的安瓦尔被“引渡”到埃及开罗，交给当地的中情局特工道格拉斯·弗里曼（杰克·吉伦哈尔饰）和狡猾的当地特工审讯。另一边，怀有刘嘉的伊莎贝拉坚信丈夫是无辜的，四处寻找丈夫的下落。在此期间，她虽然有幸得到了旧情人（彼得·萨斯加德饰）的帮助，但不足以对抗国家的强大机构，无能为力。与此同时，刚入行的特工DouglasFreeman在目睹CIA同事对安华的非人审讯时，也面临良心质疑。安华是恐怖分子吗？伊莎贝拉能否与丈夫团聚？中情局新手道格拉斯弗里曼在这场黑暗战争中扮演了什么角色？这个问题的答案肯定会导致对“引渡”政策的重新审视。