《穿越时空的少女》吉山美优（黑岛优奈饰）是一名高中三年级学生。临近毕业季，升学压力逐渐减小，让米雨时常感到不开心。一天放学后，魏宇在科学实验室里闻到了一股奇怪的香味。她万万没想到，自己竟然获得了穿越时空的能力。对魏语来说，这突如其来的变化，为她打开了通往新世界的大门。带领她走向辉煌的传奇。深町翔平（菊池文茂饰）是美优的同学，两人是青梅竹马的玩伴。然而让美优没想到的是，翔平的真实身份竟然是来自未来的人。在未来的世界里，翔平是一名科学家。是他研制出了可以穿越时空的魔药，却也让自己回到了过去，被困在了未雨的那个时代。一个来自未来的男孩，一个还不如穿越时空的女孩，两人之间又会爆发出怎样的故事呢？