《沉默的证人》雨夜，香港法医重心遭遇一伙训练有素的悍匪的洗劫。来者挟持陈嘉豪（张家辉饰）乔琳（杨紫饰）两位法医，抑制他们寻找一具特殊尸体并找出尸体体内的一颗子弹。法医在解剖的进程中发现，子弹事关一场黑帮血拼的大案，而匪首SANTA（任贤齐饰）的身份也另有蹊跷。为了保护证物揭开真相，手无寸铁的陈嘉豪乔琳，利用身边一切不妨利用的器械，和法医中心的特殊地势进行布局抨击。渐渐被激怒的匪徒更加狂躁嗜血，陷入绝境的法医们，无畏楼毁人亡的紧急，决心硬刚到底！