《新火烧红莲寺》清朝时期，少林寺企图抗击清朝，被清兵所毁。少林弟子四散，清宫鹰犬追赶……少林居士方世玉（纪天生饰）和师叔知能大师在沙漠中逃过清兵，遇到豆豆（李若彤饰）从良妓女。三人在危难中相遇。方诗雨对豆豆一见钟情。清兵包围了三人，惨死。时雨和豆豆被带回红莲寺。红莲寺强迫密密麻麻的少林弟子在神明（黄锦江）的控制下为奴。原少林弟子洪希关臣服于神，控制工头，与方士玉交手。方诗雨被神算计，奄奄一息。红莲寺内机构众多，少林弟子常被杀戮劳苦。被神功收为最爱姬的豆豆，求着方诗玉的命。一群少林子弟决心冲出红莲寺，回归自由……