《十二猴子国语》公元2035年，人类被12猴大军开发的病毒入侵。大多数人在这场病毒灾难中丧生。只有少数人侥幸逃脱，但只能在黑暗的地下生存。科学家决定派人穿越回1996年，追查12猴大军的来历。囚犯詹姆斯科尔（布鲁斯威利斯）被选为理想人选。一次偶然的机会，科尔回到了1990年，当时他正在向当时的人们描绘未来的大灾难，却被医生凯瑟琳·雪莉（玛德琳·斯托饰）抓获为精神病患者。)诊断为精神分裂症。科尔在患者同伴杰弗里·戈因斯的帮助下逃脱并回到了未来。科尔再次被送回了1996年，因为12猴大军的来历不明。这一次，科尔发现，12猴大军的起源地在费城。他找到了医生凯瑟琳，两人开始了追查十二猴大军的冒险！