《神探飞机头3》艾斯回到佛罗里达，娶了女友梅丽莎，并生下了一个可爱的男孩。但他还是不愿意安定下来，好奇的天性驱使他跑到很远的地方办案，一走就再也没有音讯。后来，梅丽莎成为了一名动物园管理员，并与她的儿子艾斯住在一起。然而，艾斯和他的父亲一样，对事情充满了好奇，不得不追根究底。最近，他帮同学调查失踪的宠物，惹了不少麻烦。当动物园里的熊猫被偷走，梅丽莎以假名被逮捕时，具有调查性质的小艾斯立即行动，决心帮助母亲将真正的罪犯绳之以法。