《圣阿加莎》20世纪50年代，美国乔治亚州。女孩玛丽·路易斯（萨布丽娜科恩SabrinaKern饰）与男友陷入热恋。浪漫之夜，年轻男女偷尝禁果，却间接导致了一场灾难。猖獗酗酒的父亲愈加暴戾无常，为了保护即将出世的孩子，玛丽逃进由一栋大别墅改造的神女修道院寻求庇护。这里地处偏僻，几乎与世隔绝，修女们道貌岸然，以至偏执得几近变态。住在这里的女孩们战战兢兢，惶惶不可终日。不久，玛丽被赐名阿加莎，她仿佛成为修道院的囚徒，失去了身体和灵魂的自由。万事并未好转，女孩的生活朝着更黑暗的方向走去……