《日本列岛动物物语》由6800多个岛屿组成的日本列岛，总计9万余种的动物生存于此。从南到北，由西向东，无论环境友好或是严苛，可爱的动物们慷慨地接受大自然的赠予，也勇敢地承受一切严酷的考验。屋久岛和下北半岛的森林中，猕猴们快乐地度过每一天，同时他们难以割舍的母子之情经历着暴风与严寒的洗礼；知床半岛的森林中，棕熊兄弟玩耍打闹，学习着生存的技能；北海道钏路湿原，北狐妈妈在孩子刚刚长大便将它们赶走，唆使孩子们在有限的生命内经历大自然的考验；北海的襟裳岬，小海豹刚出生不久便险些与妈妈失散，这似乎注定了它多舛的命运；南海海底，充分多样的海洋生物自由穿梭，俨然一个快乐当然也充满凶险的海底乐园。