《盘尼西林1944》无锡城，月暗，风高。游击队员林晓洁和未婚夫阿甜将刚从日本鬼子手中抓获的两盒青霉素押送回组织。没想到在途中遇到了傀儡军刘二。经过一场激战，阿天为保护小杰被捕，两盒青霉素被还给了伪军。林小洁无奈地逃了出来，但她心里永远不会忘记阿天，也永远不会忘记阿天被捕时的叮嘱，她一定能找到那两盒青霉素。不久，林晓洁以学生身份回到无锡，与姐夫兼地下游击队慕容轩汇合。可她不知道，她的双胞胎妹妹林晓婷已经进入了日本军方的特殊高科技部门，成为了高家驹科长的得力顾问，而晓婷的任务就是找到那两盒青霉素。然而这一次军队已经察觉到游击队的动静，两盒青霉素毫无头绪，这让小婷和小杰焦急万分。尤其是肖杰一时冲动，刺杀了抓捕阿天的汉奸刘二，使得高科高科长高家驹加大了对地下游击队的抓捕力度。很快，他找到了一个线索，一个绰号小关东的大学生。这时候，林小杰查过之后，在日军中找到了一席之地……