《精灵鼠小弟2》经过两年的共同生活，斯图尔特和乔治一家现在和睦相处。斯图尔特还是一如既往的聪明精灵，但他对一件事有些不安——乔治的妈妈加了一个年幼的女儿，他们非常爱这个女儿，几乎把所有的时间和精力都花在了身上。而乔治的功课越来越忙，陪伴斯图尔特的时间也越来越少。在遇到鸽子玛格罗之前，斯图尔特有点孤单。斯图亚特上演了英雄救美、救玛格罗脱离险境、带她回家疗伤的场景，暗暗佩服她。然而，斯图尔特的爱情并不是特别顺利。他不知道玛格罗有一个不为人知的秘密，而这只机智勇敢的老鼠又面临着另一场充满挑战的冒险。