《还珠格格第三部》虽和五阿哥永琪（古巨基饰）最闭幕为连理，但是小燕子（黄奕饰）丝毫不改调皮顽劣的本性，伙同永琪、尔康（周杰饰）、紫薇（马伊俐饰）又惹出不少乱子，更时不时假传圣旨安排晴儿（王艳饰）和萧剑（黄晓明饰）见面。在此过程中，小燕子渐渐弄清了自己的身世，由此对永琪和一向亲近的皇阿玛产生了冲突复杂的情怀。皇太后担心永琪的子嗣问题，遂将美女知画（秦岚饰）送到永琪身边，也使得小燕子和永琪之间产生更大的裂痕。不久，边疆发生战乱，尔康随军南下，他和紫薇也面临着生离死别的考验……本片根据台湾驰名言情小说家琼瑶的同名原著改编。