《韩赛尔与格蕾特：女巫猎人》在童年时代便消灭了糖果屋女巫的孤儿兄妹韩赛尔（杰瑞米·雷纳JeremyRenner饰）与格蕾特（杰玛·阿特登GemmaArterton饰），多年来成为邪恶女巫的最大克星。在扶助小镇奥古斯伯格寻找失踪的孩子以及湮没女巫之时，兄妹二人发现三天后行将展示“血月”（月蚀），这对女巫们来说是无比重要和神圣的时刻。两兄妹赶快投入行动，而讨厌他们俩的警长也招来一伙人马追查女巫们的行踪。未过多久，女巫头目（法米克·詹森FamkeJanssen饰）率领手下袭击小镇，与兄妹二人展开正面冲突。激战过后，格蕾特受到重创，韩赛尔也随着女巫消失下落不明。正邪的较量渐次升级，兄妹俩在这一过程中也慢慢清楚关于他们童年以及父母背后的秘密……