《函馆咖啡》故事发生在一间名为翡翠馆的公寓中，荻原时子（夏树阳子饰）是公寓的处置人，这位非常有想法的女子想将公寓打造成一个能帮助年青人圆梦的场合，因此，入驻公寓的条件设置的非常奇特，不谈价格，只看前来租房子的宾客和这座公寓的气场合不合拍。住在这里的有玻璃艺人堀池一子（片冈礼子饰）、作家相泽幸太郎（中岛托尼饰）和摄影师藤村佐和（川岛和津实饰）等人。成天，一位名叫桧山英二（黄川田将也饰）的男子来到了翡翠馆，在这里，他开了一家旧书店。翡翠馆里来来常常的住客的喜怒哀乐都被佐和尽收眼底，他将他们写进了自己的小说中，取名。