《哆啦A梦：新·大雄的日本诞生修复版》在家长重重压力下想要离家出奔的大雄（大原惠美配音）、胖虎（木村昴配音）、小夫（关智一配音）和静香（嘉数由美配音），在哆啦A梦（水田山葵配音）的协助下来到了七万年前的地球。在创造属于本人的世外桃源时，他们偶遇神奇少年古古儿，继而被卷入了光明族和暗淡族的部落争斗之中。大家齐心协力智斗巨尊比，不想却发现了一个惊天神秘……