《谍影重重3》失去了心爱的女人后，波恩（马特·达蒙饰）面临着更加艰难的日子。他努力去回忆，却只能在睡梦中被一个似懂非懂的闪回惊醒，至今仍记不起自己的身份。但波恩注定不是普通人。还没等他冷静下来，“找回”自己的真实身份，中情局派出的凶手就紧随其后。连续几场较量后，杰森·伯恩终于彻底被激怒了，决定还击——他主动追击凶手，去过莫斯科和马德里。巴黎，也在伦敦和丹吉尔停留。问题一一解决后，杰森回到纽约，在那里他将找到所有答案并找到自己的身份。