《谍影重重2》经过上一集的腥风血雨之后，伯恩（马特·达蒙饰）和女朋友玛丽（弗兰卡·泼坦特饰）隐居在印度偏僻的海边小镇，想忘记以前的生活。一天，神秘组织的杀手来到小镇，打破了伯恩二人世界的宁静，女友玛丽在逃亡途中被枪杀。为了查出真相，伯恩重新开始战斗，他发现以前工作的中情局开始重新寻找他，本人被卷入了一场刺杀活动中，被人诬陷妨害了中情局的一次情报交易，残害特工。伯恩别无选择，他只能找到混充本人的人，本领洗刷清白，为女友报恩。