《赤道》韩国秘密核武器神秘消失，同时载着军方手提装置的飞机在中国境内坠毁。韩方接到消息，一名疑似绰号“赤道”的危险人物（张震饰）带着助手“信差”（文咏珊饰）将于香港实行秘密武器交易，韩国武器专家崔民号（池珍熙饰）与特工朴宇哲（崔始源饰）奉命前往调查。香港反恐特勤组主管李彦明（张家辉饰）与督察范家明（余文乐饰）协助韩方寻找武器，而核物理教授肇志仁（张学友饰）也受邀协助判案。武器很快被寻回，没想到竟还隐藏着潜在紧急。正当香港及韩国警方决定送还武器回韩国之际，大陆安全局高管（王学圻饰）带着助手袁小姐（冯文娟饰）突然出现，三方陷入周旋之中，原来“赤道”另有其人，而他们一伙儿的阴谋也开始实施……