《藏药令》长期居住在草药村的板蓝根精灵小兰（林小斋饰）意外救下了能够冲破草药村屏障的医官阿九（潘奕宏饰）。谁知道阿九不仅是德高望重的“九大神医”，还有银安的身份——夺取草药灵的上清司统帅九明。小兰和阿九意外地结成了生死与共的心灵伴侣。这引发了一场猫鼠游戏，揭示了两人前世今生的羁绊。