《碧蓝幻想第二季》现在，再一次去往宏大的蓝天——。憧憬天空、以星之岛为目标的少年，与从天而降、不行思议的蓝发少女，两人成为了命运与生命的共通体。向天空出发的少年与少女，与值得信赖的同伴和前往目的地的骑空艇相逢。经由躲避帝国的追击，以及与星晶兽的邂逅，两人加深了牵绊并逐渐成长。但前往星之岛的路程还只过了一半。少年与少女和同伴所有，向着接下来的旅程进发。