《阿凡达加长版》战斗中负伤而下身瘫痪的前海军战士杰克•萨利（萨姆•沃辛顿SamWorthington饰）决定替死去的同胞哥哥来到潘多拉星操纵格蕾丝博士（西格妮•韦弗SigourneyWeaver饰）用人类基因与当地纳美部族基因结合创造出的“阿凡达”混血生物。杰克的目的是打入纳美部落，外交说服他们自愿离开世代居住的家园，从而SecFor公司可砍伐殆尽该地区的原始森林，开采地下昂贵的“不可得”矿。在探索潘多拉星的过程中，杰克碰到了纳美部落的公主娜蒂瑞（佐伊•索尔达娜ZoeSaldana饰），向她学习了纳美人的生存技能与对待自然的态度。与此同时，SecFor公司的经理和军方代表上校迈尔斯（史蒂芬•朗StephenLang饰）逐渐丧失耐心，决定诉诸武力驱赶纳美人……