《ST红白的搜查档案》在日本国际大都会东京，光天化日之下发生了一场性质极其恶劣的抢劫案。当某个路口发生奇怪的交通事故时，科学调查组（ST）找出了事故的始作俑者，天才黑客林彻（中山裕介饰）。然而，ST的首领赤城左门（藤原龙也饰）却在众人对春日木的指责面前回避了。不久之后，弘树在火灾中丧生，赤城被他的同事作为重要嫌疑人逮捕。青山翔（志田美久饰）、翠由纪（芦名星饰）、黑崎雄二（由田政孝饰）、山吹斋藏（三宅弘饰）等手下自然不会相信赤木的表白。为查明真相，莉莉鲁特故意作案，进入看守所，试图近距离聆听赤城的声音。而在关键时刻，赤城越狱……这部电影是根据绀野敏的原著改编的。