《駐在刑事1奥多摩渓谷・殺意の夜想曲》元警視庁捜査一課の刑事・江波敦史（寺島進）は、現在は奥多摩・水根の駐在所勤務の警察官。闇金融の老婆殺人事件の取り調べ中に被疑者を自殺させてしまった責任を問われて一課を追われ「駐在さん」として住民の問題を解決する日々を過ごしている。江波を慕っていた刑事・南村（鳥羽潤）は、一課に戻ってきてほしいと願っているようだ。そんな中、江波が老婆殺人の犯人とにらんでいた男の死体が崖の下で見つかる。