《终结的炽天使》故事发生在遥远的未来，一种神秘的病毒入侵地球，十三岁以上的人类全部灭绝。然而，对于幸存下来的孩子们来说，活着并不意味着幸运，而剥削的竟然是部落成为了地球的统治者，这些孩子被“抚养”成了他们的口粮。Yuichiro（IrinoFreedom配音）和Miguel（KenshoOno配音）并没有承诺向命运低头。为了抵抗，由一郎加入了日本帝国鬼军，成为了月鬼团的一员。在那里，勇一郎遇到了特立独行的柊木筱谷（早见沙织配音）、柔弱的早乙女雄一（冈本信彦配音）、温文尔雅的十方俊月（石川凯莲配音）和无忧无虑的三宫三叶（井口由香配音）)，五人成为了生死共存的战友。