《游戏王VRAINS》故事的舞台是“DENCITY”，一座网络系统发达的城市。有一个名为“LINKVRAINS”的VR空间，是由“SOL奔极杀”这个巨头公司通过高阶网络技术打造的。人们疯狂地渴望在那个VR空间中体验一场新的决斗。然而，在“LINKVRAINS”中，出现了使用决斗进行黑客攻击的神秘黑客组织“河内骑士团”。他们的目标是摧毁存在于互联网某处的“人工智能=电子世界”。但当世界受到这样的威胁时，却有一位决斗者站了出来。他的名字叫“Playmaker”。在那场传奇的战斗中，“Playmaker”用压倒性的决斗打败了“河内骑士团”，成功俘获了“SOL科技社”和“河内骑士团”都想成功的粉丝AI。程序。他曾一度拯救世界，然后突然消失，他的名字瞬间名扬网络世界，成为传奇。而现在，作为“Playmaker”的真身……