《英雄第二季》许多超本领者在得到超能力后，仍试图变回平凡人，过普通人的生活，但神秘构造H.R.G和“食脑人”赛勒（扎克瑞·昆图ZacharyQuinto饰）却不肯放过他们。“啦啦队长”克莱尔（海顿·潘妮蒂尔HaydenPanettiere饰）和养父班奈特（杰克·科曼JackColeman饰）一家隐居在加州，却创造同学里也隐藏着H.R.G成员；“分裂女”妮基（阿丽·拉特尔AliLarter饰）一心带着儿子过正常生活，却创造被人监视；积极“核爆”的皮特（米洛·文堤米利亚MiloVentimiglia饰）带着神秘伤疤又回来了，犹如变成了另一个人，和哥哥内森（AdrianPasdar饰）的纠葛也在连接……