《伊甸之东》故事开始于1960年代，当时学生运动领袖李克祖（李钟元饰）来到偏远的矿井赎罪，化名矿工。在与贪婪阴险的矿主申泰焕（赵敏基饰）战斗的过程中，李吉哲倒下了。落入后者的圈套，不幸丢了性命。李吉哲的长子李东哲（宋承宪饰）目睹了这一切，悲痛欲绝的他发誓要为父亲报仇雪恨。与此同时，美爱护士为了报复申泰焕的混乱遗弃，抛弃了申泰焕和李基哲的孩子。就这样，申泰焕的孩子明勋（朴海镇饰）成为了李东哲的弟弟，而李吉哲的儿子李东旭（朴海镇饰）延政勋也长大了在申泰焕的膝盖下。随着时间的流逝，当明勋和李东旭的混血经历逐渐浮出水面时，他们的人生轨迹也被扭曲了。