《崖上的波妞》波塞冬的女儿海神波妞逃出深海玩耍，却被困在玻璃瓶中被冲上岸。她碰巧被住在岸边悬崖上的宗介救了出来，两人相遇了。但波妞的父亲魔术师藤本认为人间肮脏丑陋，强行将波妞带回大海。面对父亲的阻挠，席卷小镇的海啸，以及长期失去魔法的威胁，波妞仍然做出了一个大胆而坚定的决定——成为人类，与宗介在一起。而许久许诺保护金鱼姬的宗介，即将面临新的挑战……