《学园BASARA》活跃在校内的武将们在现代高中再次激战：原学生会长「丰臣秀吉」被停学，校内群雄割据，争夺名额成为乱世新总统的职位。足球部的王牌“真田幸村”、棒球部的王牌“伊达政宗”、高呼团结就是力量的“德川家康”、决心打败家康的“石田三成”等人加入战斗一一个接一个——这乱糟糟的学园，还会有明天吗？