《我的秘密花园2》耀辉（张天霖饰）失踪后，小敏与恩恩（林依晨饰）和文静（梁又琳饰）一起来到了澎湖散心，在这里，小敏意外的邂逅了名为小武（陈宇凡饰）的陌生男子。之后，小敏返回台北，得知妈妈要搬过来和她同住，还要在这里开一个咖啡馆，虽然百般的不情愿，但小敏只能无奈成为了妈妈的帮手。　　一次偶然之中，小敏救下了一位溺水的女孩小雯（林立雯饰），哪知道小雯非但不感谢小敏的救命之恩，两人之间还产生了许多冲突。然而，当小敏了解到小雯的灾难过去之后对她心生恻隐，两人不仅化解了误会，还成为了朋友。某日，小敏竟然意外的和小武重逢，得知后者和自己有着相似的经历，两颗孤独的心渐渐靠近，就在此时，耀辉忽然回到了小敏的身边。