《未来杀手2016》未来时空，社会动荡不安，权力集中在“首领”的专制政府手中，每个人的生活都被严密监控。人们没有自由和隐私。，代号为“控制器”。而“秃鹰”是这些杀手中的佼佼者。在一次任务中，秃鹰遇到了一个名叫尼娜的女人，这个女人长得很像他已故的妻子，秃鹰放走了尼娜。但违抗命令的秃鹰被首领抛弃，控制者却提出通过给秃鹰植入“记忆”，将他改造为完美的武器。行动结束后，秃鹰逃离了组织，救下妮娜后一同逃走。然而，随着阴谋一一被揭穿，真相也逐渐浮出水面。尼娜的记忆是假的，控制者打算用秃鹰刺杀首领，取而代之。秃鹰的妻子也没有死，只是作为控制他的工具被囚禁起来。经过几次激烈的交锋，秃鹰终于实现了对控制者和首领的报复。