《豚鼠特攻队》隶属于美国政府特工部门的科学家本(扎克·加利凡纳基斯饰)通过高科技技能训练豚鼠说话和思考,并将它们培养成特工。然而,本的部门却面临着被联邦调查局关闭的境地。为了证明自己和豚鼠特工的本事,本命令豚鼠特工团队的负责人达尔文(山姆洛克威尔配音)渗透网络行业。首席执行官罗纳德赛博(BillNighy)的办公室,正在寻找罗纳德向中东国家出售军用高科技芯片的证据。达尔文毫不逊色,有Braster(TracyMorgan配音)、Valles(PenelopeCruzPenélopeCruz配音)、Mochithefly和Specks(NicolasCage配音)等成员迅速行动。这群豚鼠特工体型虽小,却有着独特的能力。他们成功闯入罗纳德的办公室并下载了重要信息。然而,这场冒险才刚刚开始……