《突击莉莉》故事发生在未来世界。那个时候，凭空出现的一种叫做“巨大”的生命体，将人类的命运带到了毁灭的边缘。此刻，世界各国联合起来，制造出能够与HUGE抗衡的武器，而只使用这些武器的少女的脸就叫做莉莉。很快，世界各地为莉莉设立了专门的学校“盖德”。每所学校都有自己的名字和特色。我们的女主角一琉璃（赤尾光饰）就读于百合丘女子学院。以冷漠和个性对待他人的白井梦之（夏吉佑子配音）、金汤匙出生的努维尔（伊泽美香子配音）和拥有超高智商和广博学识的二川二见（西本饰）配音）.在学校里，Riri了解到这些并排场所的错误。