《杀手寓言第二章》任何目的都能在六秒内解决，有如传说般存在的天才杀手「寓言」（冈田准一饰），是个让黑社会闻风丧胆的狠角色。因应「老板」（佐藤浩市饰）命令，他与搭档（木村文乃饰）乔装兄妹档，并化名「佐藤明」过着普通人生活，更不得在大坂居住的这一年内杀害任何人…。某天，他偶然遇见神祕的轮椅少女（平手友梨奈饰），以及看似关爱孩子未来的非盈利组织创办人宇津帆（堤真一饰）。种种不寻常的一切，让寓言回想起四年前的暗害任务。面对风雨欲来的重重危机，寓言能否继续按照不杀人的命令，保护自己与身边的亲友呢？