《十三号仓库第一季》在华盛顿特区的一个博物馆招待会上，一个古老的头雕向邪恶势力发出了召唤。博物馆的一名工作人员神奇地冲向了刚进来的美国总统。特勤局特工米卡（乔安妮凯利（JoanneKelly））和特工皮特（EddieMcClintock）不惧危险，保护总统，解决了石质紧急情况。事故当晚，两人收到了一封委托书弗雷德里克夫人（SheePoundCCHPounder饰）作为搭档，他们去南达科他州一个荒凉的地方执行任务。任务的持续时间是-没有时间限制。这个绝密地点叫做Warehouse13。这个地方原本是一个巨大的仓库，仓库里存放的东西都是一些非常奇怪的“艺术品”，这些艺术品是从各地收集而来的，而这两个特工的新工作就是寻找具有“未知能力”的艺术品收藏。