《时光沙漏》只有3分钟，让我爱好上你。不想和任何人打交道。不长于与人交往的森谷美铃，是一名有着时间遏止3分钟的能力的高中生。某天，她在时间遏止的期间内，试着窥视了班级第一的美少女·村上遥的裙子。然而，不知为何，村上对于时间停止的力量并没有功效，神秘暴露了。作为抱歉，森谷答应随时听取村上的请求……