《神秘小镇2013》住在宾夕法尼亚州的泰勒家族的两个兄弟姐妹：美丽开朗的霍莉（伊丽莎白·哈诺伊斯饰）和害羞内敛的内森（瑞安·马尔加里尼饰）在同一所高中。一天放学后，等待霍莉回家练习啦啦队长的内森被两个谜语男孩带走，下落不明。接下来的两年里，这件事像乌云一样萦绕在霍莉的心中，从未消散。一天，霍莉不小心在市场上找到了关于她弟弟的线索，她开车到列敦寻找。小镇毫无生气，冰冷，荒凉的街道上，似乎有无数双眼睛在窥视着外人。惊恐万分的霍莉向负责她哥哥案件的镇长理查德（方基默·瓦尔基尔默饰）寻求帮助，却被对方冷漠拒绝。在警长的女儿安伯（迪奥拉·贝尔德饰）的帮助下，霍莉当年能够删除文件和当事人。沉柯久违的案子再度被提起，小镇背后的真相慢慢揭开……