《少女怪谈》在首尔独自求学的姜仁秀（姜河那饰）从小就拥有能够看到异世界众生的能力。虽然有祖父的护身符保护着他，但他对鬼魂的不断骚扰感到恼火，所以他决定搬回家乡和叔叔一起生活。出生在一个驱鬼世家，舅舅却因为之前的经历患上了荒野恐惧症，一直宅在家里不肯出来。从学校转学的仁秀对朴贤智（韩惠林饰）和海澈（朴斗植饰）怀有敌意。同时，他还与美丽的女高中生幽灵（金素恩饰）成为搭档。在此之前，任秀班上一个叫石溪的女生自杀了，和仙芝在一起的女生也相继失踪。于是，关于世熙报复的传言开始流传。校园的残酷欺凌让纯真少女走上了绝路，无人相助的世熙在生死之间徘徊……