《少年有点酷2》在合唱团友人的努力下，校园的课外活动终于恢复了，但校长知念却有了新的策略。她单枪匹马地推动了许多俱乐部为了选票而混战。为了始终如一地管理学生，她还创造了一个控制学生校园生活方方面面的尝试……孩子们成长的烦恼正在慢慢浮现：周陌因为她的少女声音和肥胖的身体而自卑；高士元无法定义自己对孙天生的感情莫名的深情；格桑急需大笔奖学金，无奈转入光明中学；艾小欣和三个不知名的女人在一起，不想被其他朋友知道；一张无名的癌症检测单，让每个人都感受到了死亡的概念，陷入了恐惧……